Tiếp nối câu chuyện từ phần trước, Bậc Thầy Tình Dục phần 2 tiếp tục đưa người xem theo chân công trình nghiên cứu về giới tính của Bill vốn đã bị phản bác tại bệnh viện nơi ông làm việc, trong phần này Bill bắt đầu làm việc ở vị trí mới dưới sự bảo hộ của một người mới cho phép ông duy trì công trình nghiên cứu của mình. Cặp đôi Bill và Virginia vẫn tiếp tục hẹn hò, mặc dù họ không muốn thừa nhận mối quan hệ của họ.
Trong Bậc Thầy Tình Dục phần 2, Bill và Virginia tiếp tục mối quan hệ chuyên nghiệp và cá nhân, cả hai đều khẳng định họ làm như vậy là để tiếp tục sự nghiệp của công việc của họ. Virginia phá vỡ những tin tức để Ethan và Bill cố gắng để có mặt ở đó cho Libby và em bé mới của họ, nhưng điều này ngày càng làm khó họ. Trong khi Bill đang phải vật lộn với việc đưa sự nghiệp của mình thăng hoa trở lại thì Virginia vẫn còn làm việc cho tiến sĩ DePaul để học hỏi thêm nhiều điều mới. Scully thì đang có cơ hội lớn để thành công trong “liệu pháp” của ông, nhưng Margaret sẽ không vì áp lực mà ảo tưởng thêm nữa trong sự nghiệp của mình.