Sau thành công vang dội của Cung Tâm Kế, TVB từ lâu đã nuôi ý tưởng thực hiện phần 2 của tựa phim này, thực tế nhà đài đã tận dụng độ hot của phim để sản xuất Công Chúa giá Đáo ra mắt năm 2010, tuy nhiên một phần mới chính thức thì chỉ là sự ấp ủ trong suốt gần chục năm để rồi năm 2017 sau những trục trặc về khâu diễn viên thì nó cũng được khởi quay và năm 2018 thì tập đầu tiên của Cung Tâm Kế phần 2 cũng được lên sóng. Phần này được lấy tựa mới là Thâm Cung Kế, giám chế Mai Tiểu Thanh vẫn là người cầm trịch trong khi dàn diễn viên qua nhiều năm đã có nhiều sự thay đổi, không còn Dương Di hay Xa Thi Mạn mà thay vào đó là Trần Vỹ và Hồ Định Hân, bên cạnh là những gương mặt quen thuộc như Mã Quốc Minh, Mễ Tuyết, Mã Tuấn Vỹ, Tiêu Chính Nam, ngoài ra dàn nữ còn có Huỳnh Tâm Dĩnh, Lưu Tâm Du và Châu Tú Na. Phần này được hợp tác đại lục nên màu sắc phim có sự thay đổi.
Bối cảnh của Thâm Cung Kế được lấy vào thời Đường Long, Thái tử Lý Long Cơ (Mã Tuấn Vỹ) và công chúa Thái Bình (Trần Vỹ) bắt tay với nhau để phát động chính biến, mục đích là để tiêu diệt gia tộc của kẻ đang thao túng triều đình và làm xói mòn hệ thống pháp luật nhà Đường – Vi Thị (Mễ Tuyết). Cơ và Bình đều ủng hộ Lý Đán (Lý Long Cơ) nắm giữ triều cương. 2 người tưởng rằng lần đảo chính này đã đem lại sự bình yên cho chốn cung cấm thế nhưng không lâu sau những cơn sóng ngầm của các thế lực tranh quyền đoạt vị vẫn cuồn cuộn dâng trào.
Và rồi, tham vọng chính trị khác nhau khiến quan hệ giữa Long Cơ và Thái Bình dần trở nên xấu đi, thành kẻ thù “không đội trời chung”. Sự chia rẽ này như giọt nước tràn ly, làm trỗi dậy cuộc chiến không hồi kết ở thâm cung. Trong đó, nổi bật là người đứng đầu hậu cung, Hoàng hậu Vương Trân (Hồ Định Hân). Trân dùng mọi thủ đoạn, không ngại lừa trên dối dưới để hạ gục đối phương, đấu đá với bọn phi tần. Giữa trùng trùng mưu hèn kế bẩn, sự xuất hiện của Nguyên Nguyệt (Lưu Tâm Du) như dòng nước mát lành. Bên cạnh đó là nàng Cam Nhược Thiên (do Huỳnh Tâm Dĩnh đóng), tướng quân Nhậm Tam Thứ (Mã Quốc Minh) và Hà Ly (Tiêu Chính Nam). Họ đều là những người vì tình mà sẵn sàng từ bỏ tất cả.
Phía sau bức tường thành cao vợi, những câu chuyện yêu hận tình thù, rúng động tâm can đã diễn ra. Nhưng cùng lúc đó, nhiều vụ án và cái chết kỳ lạ cũng bắt đầu hé lộ nhiều bí mật kinh thiên động địa…